La ratio Champignons sur Bactéries (F/B) - Historique des versions

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2023-12-18T10:52:30Z

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‎Pourquoi mesurer la Biomasse microbienne moléculaire ?

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‎Pourquoi mesurer la Biomasse microbienne moléculaire ?

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‎Comment interpréter la Biomasse microbienne moléculaire ?

Admin : /* La méthode d’analyse */

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‎La méthode d’analyse

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‎La méthode d’analyse

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‎La méthode d’analyse

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‎La méthode d’analyse

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 == Références bibliographiques :==
 - Bardgett, R.D., McAlister, E., 1999. The measurement of soil fungal:Bacterial biomass ratios as an indicator of ecosystem self-regulation in temperate meadow grass¬lands. Biol. Fertil. Soils 29, 282–290.
 - Bailey, Vanessa L., Jeffrey L. Smith, and H. Bolton Jr. «Fungal-to-bacterial ratios in soils investigated for enhanced C sequestration.» Soil Biology and Biochemistry 34.7 (2002): 997-1007.
 - Djemiel C., Dequiedt S., Bailly A., Tripied J., Lelièvre M., Horrigue W., Jolivet C., Bispo A., Saby N., Valé M., Maron P-A., Ranjard L., Terrat S., Biogeographical patterns of the soil fungal:bacterial ratio across France, 2023, 20p.
 - Malik, Ashish A., et al. «Soil fungal: bacterial ratios are linked to altered carbon cycling.» Frontiers in Microbiology 7 (2016): 1247.
 - Morugán-Coronado, Alicia, et al. «The impact of crop diversification, tillage and fertilization type on soil total microbial, fungal and bacterial abundance: A worldwide meta-analysis of agricultural sites.» Agriculture, Ecosystems & Environment 329 (2022): 107867.
 - NF EN ISO 11063:2020 Qualité du sol - Extraction directe de l’ADN du sol
 - Six, J., Frey, S. D., Thiet, R. K., and Batten, K. M. (2006). Bacterial and fungal contributions to carbon sequestration in agroecosystems. Soil Sci. Soc. Am. J. 70, 555–569. doi: 10.2136/sssaj2004.0347
 - Strickland, M. S., and Rousk, J. (2010). Considering fungal:bacterial dominance in soils – Methods, controls, and ecosystem implications. Soil Biol. Biochem. 42, 1385–1395. doi: 10.1016/j.soilbio.2010.05.007
 - Sünnemann, M., Alt, C., Kostin, J. E., Lochner, A., Reitz, T., Siebert, J., Schädler, M., & Eisenhauer, N. (2021). Low-intensity land-use enhances soil microbial activity, bio¬mass and fungal-to-bacterial ratio in current and future climates. Journal of Applied Ecology, 58, 2614–2625. https://doi.org/10.1111/1365-2664.14004

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 Les microorganismes interviennent dans des fonctions essentielles à la fertilité des sols :
 •	Dynamique des nutriments et du carbone : décomposition des matières organiques, minéralisation N, P, S ;
 •	Agrégation et stabilisation de la structure du sol : sécrétion de mucilages et développement des hyphes ;
 •	Dégradation des polluants organiques (pesticides, hydrocarbures, ...) et transformation des éléments métalliques ;
 •	Contrôle biologique des bioagresseurs.

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 Les microorganismes interviennent dans des fonctions essentielles à la fertilité des sols :
--	Dynamique des nutriments et du carbone : décomposition des matières organiques, minéralisation N, P, S ;
+•	Dynamique des nutriments et du carbone : décomposition des matières organiques, minéralisation N, P, S ;
--	Agrégation et stabilisation de la structure du sol : sécrétion de mucilages et développement des hyphes ;
+•	Agrégation et stabilisation de la structure du sol : sécrétion de mucilages et développement des hyphes ;
--	Dégradation des polluants organiques (pesticides, hydrocarbures, ...) et transformation des éléments métalliques ;
+•	Dégradation des polluants organiques (pesticides, hydrocarbures, ...) et transformation des éléments métalliques ;
--	Contrôle biologique des bioagresseurs.
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 Les bactéries et champignons ont des implications différentes dans les processus et fonctions du sol, le ratio F/B peut donc en soi être informatif d’orientations fonctionnelles. Une dominance des bactéries oriente vers une voie préférentielle de minéralisation rapide de la matière organique, alors qu’une dominance des champignons oriente vers une voie préférentielle de minéralisation longue avec comme effets une meilleure stabilisation du carbone et une meilleure stabilité des agrégats du sol (Six et al., 2006 ; Strickland and Rousk, 2010 ; Malik et al., 2016)
 == Références bibliographiques :==

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 Ces paramètres physico-chimiques explicatifs permettent d’estimer quatre valeurs de référence pour chaque parcelle analysée, afin de définir les zones en vert, jaune et rouge. La comparaison de ces valeurs de référence avec la valeur mesurée permet d’émettre un diagnostic de l’impact des pratiques culturales sur le ratio F/B.
-[[Fichier:Image15.jpg]]
+[[Fichier:Image15.jpg|center]]
-Exemple de visualisation de l’interprétation de l’indicateur F/B
+<CENTER> Exemple de visualisation de l’interprétation de l’indicateur F/B</CENTER>
 == Les effets des pratiques culturales==

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−	''Gamme de valeurs du ratio F/B par usage</CENTER>	+	[[Fichier:Image13.jpeg\|center]]
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-''Effet des grands modes d’usage sur le ratio F/B (Djemiel et al., 2023)''
+<CENTER> Effet des grands modes d’usage sur le ratio F/B (Djemiel et al., 2023)</CENTER>
 [[Fichier:Image13.jpeg]]
-''Gamme de valeurs du ratio F/B par usage''
+''Gamme de valeurs du ratio F/B par usage</CENTER>

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 [[Fichier:qPCR-image1.jpeg|center]]
-<CENTER>Préparation des échantillons pour les qPCR<CENTER>
+<CENTER>Préparation des échantillons pour les qPCR</CENTER>
 == Les données de référence==